Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIS3P2A8K0S8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3P2A8K0S8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms