Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC169A6NNP5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC169A6NNP5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms