Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCNX2A6NKB5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCNX2A6NKB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms