Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSDA5PKW4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PSDA5PKW4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSDA5PKW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSDA5PKW4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSDA5PKW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSDA5PKW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSDA5PKW4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSDA5PKW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSDA5PKW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSDA5PKW4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSDA5PKW4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSDA5PKW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSDA5PKW4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
PSDA5PKW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSDA5PKW4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms