Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLRN2A0PK11 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLRN2A0PK11 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLRN2A0PK11 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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