Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SH2D4B-201ENST00000313455 2889 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ALAS1-202ENST00000394965 2430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 OR4A5-201ENST00000319760 1071 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TROAP-202ENST00000380327 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 Z97353.1-201ENST00000422915 578 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SHANK2-AS2-201ENST00000429268 356 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL158151.2-201ENST00000434250 241 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MIR2110-201ENST00000459421 75 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RN7SL617P-201ENST00000485298 308 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC034205.2-201ENST00000517788 1176 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC087463.4-201ENST00000561964 448 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MT1F-204ENST00000568475 416 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MIR4517-201ENST00000578855 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC022966.1-201ENST00000591685 593 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CU633906.3-201ENST00000623377 741 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RRN3P2-202ENST00000564580 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 MPP4-202ENST00000359962 2436 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LINC00222-202ENST00000416104 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 DNAI2-205ENST00000579490 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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