Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms