Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARFGEF1Q9Y6D6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms