Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AUP1Q9Y679 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms