Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPQQ9Y646 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPQQ9Y646 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms