Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A3BPQ9Y5P4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms