Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CD2APQ9Y5K6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD2APQ9Y5K6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD2APQ9Y5K6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD2APQ9Y5K6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD2APQ9Y5K6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD2APQ9Y5K6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CD2APQ9Y5K6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CD2APQ9Y5K6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms