Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAN1Q9Y2M0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAN1Q9Y2M0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms