Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HDAC5Q9UQL6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC5Q9UQL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms