Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC8A2Q9UPR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC8A2Q9UPR5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms