Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHX6Q9UPM6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX6Q9UPM6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms