Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms