Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP18Q9UMW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP18Q9UMW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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