Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNPO2Q9UMS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNPO2Q9UMS6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms