Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLEC4AQ9UMR7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLEC4AQ9UMR7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms