Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI3Q9ULW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI3Q9ULW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PADI3Q9ULW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PADI3Q9ULW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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