Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT6Q9ULM6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms