Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
INO80Q9ULG1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms