Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RIMS3Q9UJD0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIMS3Q9UJD0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms