Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLXNA1Q9UIW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms