Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTH4Q9UIA0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms