Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC3Q9UHC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms