Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRDQ9UH36 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRRDQ9UH36 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms