Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DKK4Q9UBT3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms