Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPASTQ9UBP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPASTQ9UBP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms