Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3BQ9UBC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3BQ9UBC3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms