Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGAP28Q9P2N2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms