Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RCC2Q9P258 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms