Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PODXL2Q9NZ53 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PODXL2Q9NZ53 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms