Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNK4Q9NYG8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNK4Q9NYG8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms