Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALKBH4Q9NXW9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms