Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBRD1Q9NUN5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBRD1Q9NUN5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms