Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms