Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SALL1Q9NSC2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL1Q9NSC2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL1Q9NSC2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms