Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCND1Q9NSA2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms