Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPHK2Q9NRA0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK2Q9NRA0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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