Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR9Q9NR96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR9Q9NR96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms