Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR50

EIF2B3, Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2B3Q9NR50 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF2B3Q9NR50 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF2B3Q9NR50 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms