Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BIN3Q9NQY0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BIN3Q9NQY0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms