Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPHNQ9NQX3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms