Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NRIP3Q9NQ35 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms