Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FZD3Q9NPG1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FZD3Q9NPG1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms