Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNK9Q9NPC2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNK9Q9NPC2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms