Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPCPD1Q9NPB8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms