Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms